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有了这些数据库,就算自己没有临床数据,也能发论文!

发布时间:2025-08-08 来源:石榴学术 浏览量: 字号:【加大】【减小】 手机上观看

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国外常用的医学类数据库

1. 临床与电子健康记录(EHR)数据库

  • MIMIC-III/IV

    • MIT推出的重症监护病房(ICU)患者数据库,包含生命体征、实验室检查、用药记录等(需申请访问)。

    • 官网:https://mimic.mit.edu/

  • eICU Collaborative Research Database

    • Philips与MIT合作的多中心ICU数据库,覆盖美国多家医院数据。

  • UK Biobank

    • 英国50万人的健康数据,包括临床记录、基因组、影像等(需申请)。

    • 官网:https://www.ukbiobank.ac.uk/

  • All of Us Research Program

    • 美国NIH主导的百万级人群健康数据库,涵盖多样化人群。

    • 官网:https://allofus.nih.gov/

2. 基因组与生物医学数据库

  • NCBI GeneBank & dbGaP

    • 美国国家生物技术信息中心(NCBI)的基因序列数据库和基因型-表型数据库(需申请)。

    • 官网:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/

  • TCGA (The Cancer Genome Atlas)

    • 癌症基因组数据,涵盖33种癌症的分子特征和临床数据。

    • 官网:https://www.cancer.gov/tcga

  • GTEx (Genotype-Tissue Expression)

    • 正常人体组织的基因表达与调控数据。

    • 官网:https://gtexportal.org/

  • ClinVar

    • 疾病相关基因变异的临床解读数据库。

3. 医学影像数据库

  • The Cancer Imaging Archive (TCIA)

    • 癌症影像数据集(CT/MRI/PET等),与TCGA配套。

    • 官网:https://www.cancerimagingarchive.net/

  • CheXpert

    • 斯坦福大学的胸部X光数据集,用于肺炎等疾病检测。

  • OASIS

    • 阿尔茨海默病研究的脑部MRI数据集。

    • 官网:https://www.oasis-brains.org/

4. 药物与化合物数据库

  • PubChem

    • 化学化合物、药物活性及分子结构数据库。

    • 官网:https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/

  • DrugBank

    • 药物靶点、作用机制和药代动力学数据。

    • 官网:https://go.drugbank.com/

  • ChEMBL

    • 欧洲分子生物学实验室(EMBL)的药物活性数据。

5. 流行病学与公共卫生数据库

  • WHO Global Health Observatory

    • 世界卫生组织的全球疾病负担、疫苗接种等数据。

    • 官网:https://www.who.int/data/gho

  • CDC WONDER

    • 美国疾控中心的死亡、传染病、环境健康数据。

    • 官网:https://wonder.cdc.gov/

  • Our World in Data

    • 全球健康、疾病和疫苗接种的可视化数据。

6. 其他特色数据库

  • SEER (Surveillance, Epidemiology, and End Results)

    • 美国国家癌症研究所的癌症发病率和生存率统计。

  • FAIRsharing

    • 生物医学数据库的标准化目录(可检索领域特定数据库)。

注意事项

  • 数据权限:部分数据库(如UK Biobank)需申请并通过伦理审查。

  • 数据格式:注意数据类型(如DICOM、FASTQ、CSV)及配套元数据。

  • 工具支持:许多数据库提供API或专用工具(如TCIA的NBIA工具)。

根据研究需求选择合适的数据库时,建议查阅相关论文或平台文档以确认数据的覆盖范围和访问流程。



国内常用的医学类数据库

1. 临床与健康大数据平台

  • 国家健康医疗大数据中心(中国多个区域中心)

    • 上海申康医联中心:覆盖上海市38家三甲医院临床数据。

    • 北京大学健康医疗大数据国家研究院:提供多中心临床研究数据支持。

    • 由国家卫健委主导,分布在 北京、上海、江苏、福建、山东 等地,整合了区域性医院的电子病历(EHR)、影像、检验等数据(需申请权限)。

    • 示例:

  • 中国医院质量监测系统(HQMS

    • 国家卫健委医院管理研究所主导,涵盖全国三级医院的病案首页数据(需申请)。

  • 中国卒中中心联盟(CSCA)数据库

    • 全国卒中患者的临床诊疗数据,用于脑血管病研究

2. 基因组与生物医学数据库

  • 中国国家基因库(CNGB, 深圳)

    • 全球领先的综合性基因数据库,存储中国人群基因组数据(需申请)。

    • 官网:https://www.cngb.org/

  • 中国人类遗传资源共享平台(GSA-Human)

    • 由科技部支持,提供基因组、表观组等数据(需审批)。

    • 官网:https://ngdc.cncb.ac.cn/gsa-human/

  • 国家生物信息中心(CNCB)/ 国家基因组科学数据中心(NGDC)

    • 整合多个子数据库(如GVM、GSA),涵盖微生物、癌症、新冠等数据。

    • 官网:https://ngdc.cncb.ac.cn/

3. 中医药数据库

  • 中医药大数据中心(国家中医药管理局)

    • 整合中医诊疗方案、方剂、针灸等数据。

  • TCMID (Traditional Chinese Medicine Integrated Database)

    • 中药成分、靶点及疾病关联数据库。

    • 访问:http://www.megabionet.org/tcmid/

  • TCMSP (中医药系统药理学数据库)

    • 中药活性成分、ADME参数及靶点预测工具。

    • 官网:https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php

4. 疾病与流行病学数据库

  • 中国疾病预防控制中心(CDC)公共卫生科学数据中心

    • 传染病报告、慢性病监测、营养健康等数据(部分公开)。

    • 官网:http://www.phsciencedata.cn/

  • 中国癌症登记中心(NCCR)

    • 发布《中国肿瘤登记年报》,提供地区性癌症发病率数据。

  • 中国心血管病登记(China PEACE)

    • 全国性心血管病诊疗和预后研究数据库。

5. 医学影像数据库

  • 中国医学影像AI数据库(如LUNA16)

    • 肺部CT影像数据集,用于肺结节检测算法开发。

  • EyePACS (中国糖尿病视网膜病变数据集)

    • 眼底图像数据,与国际项目合作。

6. 其他特色资源

  • 国家人口健康科学数据中心(NPHC)

    • 整合临床、基础医学、公共卫生等多领域数据(需注册)。

    • 官网:https://www.ncmi.cn/

  • 万方医学网 / 中国知网(CNKI)医学库

    • 中文医学文献数据库,含临床指南、病例报告等。

注意事项

  • 数据权限:国内医学数据通常需通过伦理审查和行政审批(如《人类遗传资源管理条例》)。

  • 语言:部分数据库仅提供中文界面。

  • 区域覆盖:不同数据库的地域代表性差异较大(如城乡差异)。

如果需要使用这些数据库,建议通过官方渠道联系相关机构,并关注 国家科技资源共享服务平台(https://www.escience.org.cn/)的最新动态。


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