近年来，随着微生物检验学科的快速发展以及临床对微生物检验依赖的加深，实验室每年会产生大量的菌株需要被保存及管理，目前仍然有很多实验室采用Excel+人工排号的方式进行菌种库管理，效率、准确性及可用性都较低。借助信息化、智能化的方式打造全流程菌种库管理，可提升管理效率及准确性。通过对HIS、EMR、PACS、LIS等系统数据进行整合，打通临床科研与菌种库之间的壁垒，形成临床病例与菌种库一体化的检索机制。智能化的菌种库特性如下：
菌种库规则建立
可按照菌目、科、属、种，以及标本类型、采集部位等进行菌株与盒子的自动分类设置，并可以选择按年进行排号，特殊情况时可以进行手工选择盒子及手工排号。
建立冰箱的层规格、抽屉的层规格以及盒子的孔位规格等，以进行精准化的菌株定位管理。
根据菌目、科、属、种、标本类型、采集部位、临床诊断等进行入库时的拦截提示设置，对特殊情况下的菌株进行精准化分类及管理。
菌种入库
针对于微生物进行菌种保藏时先进入缓存冰箱的场景，信息化系统应提供预入库、隔天入库等功能；入库时，将同期检查结果、临床主诊断、等检验领域之外信息都带入数据库中，以支撑科研场景的全面信息索引。
菌种库管理，菌株领用、归还及销毁
信息化系统应提供丰富的查询条件，快速全面地定位目标菌株，方便支撑科研，并将每次筛选到的菌株不断添加到“领用清单”中，最终进行清单打印，清单中包含冰箱、层、抽屉、盒子、行、列以及菌株相关的自然信息，极大地加快菌株的定位及收集，避免在菌种库中进行“大海捞针”。对菌种库的信息化管理应符合ISO 15189的要求，领用时采取双签名管理机制，并填写领用方式、归还计划等。归还时也同样进行双签名登记，按位入库。可以批量对指定范围的菌株进行销毁登记。
